La Préfecture de La Canée est située à l'extrême ouest de la grande île, sa superficie s'étend sur 2376 km2 et sa population compte 150.387 habitants (recensement de 2001). La Préfecture de Réthymnon se trouve aux limites est de La Canée. Ses trois côtes se déploient sur 350 kilomètres et sont bercées par la mer Méditerranée, la Mer de Crète au nord et la Mer Libyenne au sud.

La chaîne magique des Montagnes Blanches qui compte plusieurs dizaines de sommets - Pachnes étant le plus haut de tous (2454 m) - constitue la colonne vertébrale de la Préfecture. Elle traverse la Préfecture de part en part, d'ouest en est, et s'arrête près de la Préfecture de Réthymnon. Elle forme de grands plateaux - comme le plateau d'Omalos (altitude : 1080 m) et de Askyfou (altitude : 730 m) - et est découpée par des gorges sauvages d'une beauté unique, comme la gorge de Aghia Irène, de Samaria, d'Aradena, d'Imbrou et beaucoup d'autres.

Une grande plaine fertile se répand généreusement vers le nord. Elle est fécondée par des sources affluentes qui se transforment en rivières vitales, comme la rivière de Platania (l'ancien fleuve Jardanos) et la rivière de Koiliari.

Les plaines de Kisamos, de La Canée, d'Armenon et de Georgioupolis aboutissent sur les côtes à population dense et à grande exploitation touristique de la Mer de Crète.

Le relief varié de la côte nord est caractérisé par les quatre grandes péninsules et promontoires homonymes de Gramvousa, Irène (Spatha), Akrotiri et Drèpanos, parmi lesquels se sont également configurées les quatre grandes baies et ports de Kisamos, de La Canée, de Souda et de Georgioupolis. La baie de Souda est l'un des ports les plus sûrs et les plus grands de Grèce.

Contrairement à la zone nord, au sud et à l'ouest la chaîne des Lefka Ori, des Montagnes Blanches, se resserre de manière asphyxiante sur des plages dentelées, configurant une bande étroite de terre cultivée, à l'exception des plaines de Palaiochora à l'ouest et de Fragokastello à l'est. Par conséquent, les plages du sud et de l'ouest demeurent dépeuplées et moins exploitées du point de vue touristique, et préservent ainsi leur beauté sauvage et vierge.

De plus, les cinq petites baies du sud, de Palaiochora, de Sougia, d'Aghia Roumeli, de Loutros et de Hora Sfakion, ainsi que les trois baies de la côte ouest, de Livadi, de Sfinari, et de Stomio ne se prêtent pas à l'ancrage de grands bateaux de ligne. Les petites îles de la Préfecture sont inhabitées. L'îlot de Souda, de Aghioi Théodoroi ou Thodorou du golfe de La Canée, Imeri ou Agria Gramvousa au bord du cap homonyme. Gavdos constitue une exception.

Située à l'extrême sud de l'Europe, c'est la seule île habitée de Crète. Elle se trouve en face de Sfakia, à une distance de 23 miles nautiques de Hora Sfakion et à 32 miles nautiques de Palaiochora.

Enfin, le lac de Kournas à Apokorona est aussi unique en Crète, tout comme un deuxième lac, artificiellement créé à Aghia à Kydonia.